转录组数据在论文里要放的序列有：原始序列、清洗后的序列、拼接后的序列。
转录组在哪个数据库里面_转录组的功能
1、原始序列：包括测序平台产生的原始序列数据，可以存放在公共数据库中，如NCBISRA，ENA等。需要提供测序的ID号、库名、测序平台、测序长度等信息。
2、清洗后的序列：清洗后的序列文件，包括去除接头序列、低质量序列、低复杂度序列等处理的结果。需要提供序列清洗的方法、参数、清洗后的序列长度、数量等信息。
3、拼接后的序列：使用拼接工具对原始序列进行拼接，需要提供拼接后的序列文件，包括拼接率、平均长度、N50等统计信息。
转录组原始数据包括递交原始序列。
转录组有两部分数据要递交，首先是拼接的转录组序列，一般递交到tsa上，另一个是fastq的原始测序数据，一般递交到sra上。前两年还有论文只提交tsa不递交原始数据，目前发表的论文基本都要提交。这也是便于其他人可以完全重复你的实验和数据分析的必要要求。
GSA(Genome Sequence Archive)是一个存储基因组、转录组以及其他Omics原始序列数据的数据库。GSA允许用户创建、上传并存储序列数据。GSA提供对项目信息（BioProject）、样本信息（BioSample）、实验信息（Experiment）以及测序数据的有效组织与管理。
转录组测序所得的数据，怎样传到NCBI的SRA数据库
Unigene其实没有一个标准的定义。大体的概念是经过去冗余之后得到的基因序列，这条序列和其他的序列是非冗余的，也就是理论上其他序列都和此序列代表的不是同一个基因。或者是经过聚类后得到的不同的类，类和类之间是非冗余的，每个类可以认为的代表一个基因。不同的去冗余和聚类的方法得到的结果都可以称为unigene。
另外NCBI上也有Unigene的概念，是NCBI用自己的方法对序列进行聚类，它认为每一个类都的代表一个基因，并赋予一个编号：物种名字.数字，比如小麦的一个例子：Ta.191，这也是较常用的Unigene.
NR是一个数据库，是NCBI中蛋白质数据库，了许多其他数据库中的蛋白质的注释信息。异基因注释简单来说就是把有表达异的Unigene的物种、分子功能、生物学途径等等信息通过从数据库中比对，得到的结果。
unigene是Universal Gene的英文缩写，意为广泛通用的基因数据库，通过电脑对相同基因座（Locus）的收集整理形成一个非冗余的基因数据库一种生物信息学数据库（基因数据库）
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